Thủy cung thu nhỏ tại Viện Hải dương học được xem là địa điểm check in siêu lý tưởng dành cho du khách. Với vô số bể kính nuôi các loài sinh vật biển bên trong, dọc đường đi bạn có thể thoải mái quan sát thế giới sinh vật biển vô cùng đa dạng và phong phú. Các loài cá đầy màu sắc, hình thù lạ mắt cùng những thông tin về chúng sẽ làm thích thú không muốn rời khỏi đây. Viện Hải dương học với 5.000 loài và hơn 23.000 mẫu sinh vật biển, trong đó có rất nhiều mẫu sinh vật biển vô cùng quý hiếm như: cá vua, cá tầm, cá mặt trăng đuôi nhọn, hải cẩu, trai khổng lồ, cá ông chuông,…
Hoàng Sa là quần đảo thuộc tỉnh Khánh Hòa. Do đó, việc để khu trưng bày biển đảo Hoàng Sa tại đây có ý nghĩa vô cùng quan trọng. Không chỉ giúp du khách tăng thêm sự hiểu biết về chủ quyền mà còn thể hiện tự tôn dân tộc, phát huy truyền thống yêu nước của dân tộc Việt Nam. Tại đây, các bạn sẽ được chiêm ngưỡng vô vàn các loại sinh vật vật biển đang bơi lội trong bể kính. Từ các loại động vật quen thuộc cá, cua, mực đến các loài sinh vật biển hiếm thấy như cá mập, cá heo hay cá đuối. Quan sát tận mắt về hình dáng cũng hoạt động sinh hoạt hằng ngày của chúng sẽ đem đến cho du khách trải nghiệm lý thú, không thể nào quên.
Viện Hải dương học còn lưu giữ những bộ xương hóa thạch khổng lồ. Trong đó có thể kể đến: Bộ xương của loài cá voi lưng gù, bộ xương cá Nạng Hải và bộ xương của loài cá bò biển đang có nguy cơ tuyệt chủng